El jugador toma el papel de Jackie Estacado (con la voz de Kirk Acevedo), cuya cabeza tiene precio por el don de la mafia de Nueva York, Paulie Franchetti. Mientras se esconde en el cementerio, la Oscuridad (con la voz de Mike Patton), una antigua fuerza demoníaca, llamada The Darkness, que ha habitado en su familia durante varias generaciones, se despierta dentro de Jackie y mata a los mafiosos que le persiguen. Jackie consigue habilidades demoníacas que se alimentan de la oscuridad. Ahora Jackie es el cazador y quiere localizar a Paulie, pero éste y el jefe de policía corrupto Eddie Shrote secuestran a la novia de Jackie, Jenny Romano (con la voz de Lauren Ambrose). La llevan al orfanato donde Jackie y Jenny crecieron y la asesinan. Jackie es incapaz de salvar a Jenny, debido a que The Darkness lo sujeta deliberadamente.
